Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4X4

Vmn2r11, Vomeronasal 2, receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r11E9Q4X4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r11E9Q4X4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r11E9Q4X4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r11E9Q4X4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r11E9Q4X4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms