Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Z1

B230217C12Rik, RIKEN cDNA B230217C12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230217C12RikE9Q3Z1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230217C12RikE9Q3Z1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms