Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930579F01RikE9Q3L6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms