Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tarbp1E9Q368 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tarbp1E9Q368 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Tarbp1E9Q368 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms