Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430401F13RikE9Q328 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430401F13RikE9Q328 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms