Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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