Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms