Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9972E9Q053 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms