Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms