Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc175E9PVB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms