Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430403G16RikD3Z5L4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430403G16RikD3Z5L4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms