Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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