Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rexo5D3YW29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rexo5D3YW29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rexo5D3YW29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms