Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmf1B9EKI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmf1B9EKI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms