Protein–RNA interactions for Protein: B3F5L4

5830411N06Rik, RIKEN cDNA 5830411N06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830411N06RikB3F5L4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
5830411N06RikB3F5L4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5830411N06RikB3F5L4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5830411N06RikB3F5L4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms