Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppfia1B2RXQ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia1B2RXQ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms