Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cspp1B2RX88 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cspp1B2RX88 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cspp1B2RX88 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms