Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Siah3B2RWG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Siah3B2RWG3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah3B2RWG3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms