Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clrn2B2RVW2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clrn2B2RVW2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms