Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usf3B2RUQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usf3B2RUQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms