Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AU015836B2RUM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU015836B2RUM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms