Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol7aB2RT54 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apol7aB2RT54 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol7aB2RT54 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms