Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Plekhd1B2RPU2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plekhd1B2RPU2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plekhd1B2RPU2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plekhd1B2RPU2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plekhd1B2RPU2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plekhd1B2RPU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plekhd1B2RPU2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plekhd1B2RPU2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms