Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Skor2A7M7C7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Skor2A7M7C7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms