Protein–RNA interactions for Protein: A6H619

Phrf1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phrf1A6H619 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Phrf1A6H619 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phrf1A6H619 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Phrf1A6H619 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Phrf1A6H619 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phrf1A6H619 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phrf1A6H619 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms