Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll11A4Q9F4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll11A4Q9F4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms