Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn3aA2ASI5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn3aA2ASI5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms