Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn3A2ALK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms