Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SetxA2AKX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SetxA2AKX3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SetxA2AKX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SetxA2AKX3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms