Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FocadA2AKG8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FocadA2AKG8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms