Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec16aA2AIX1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec16aA2AIX1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec16aA2AIX1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms