Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2dnl2A2AFH2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2dnl2A2AFH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms