Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TomtA1Y9I9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TomtA1Y9I9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TomtA1Y9I9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TomtA1Y9I9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TomtA1Y9I9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TomtA1Y9I9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TomtA1Y9I9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TomtA1Y9I9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms