Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc112A0AUP1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc112A0AUP1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc112A0AUP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms