Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms