Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv4A0A075B5I2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv4A0A075B5I2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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