Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms