Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms