Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn8Q9Z260 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn8Q9Z260 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn8Q9Z260 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn8Q9Z260 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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