Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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