Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms