Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Chst4Q9R1I1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms