Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nphp1Q9QY53 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nphp1Q9QY53 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms