Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms