Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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