Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1fQ9JIS7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1fQ9JIS7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms