Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms