Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pfn4Q9D6I3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Pfn4Q9D6I3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms