Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms