Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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